Di tahun 2138, game virtual reality sedang booming. Yggdrasil, sebuah game online yang populer diam-diam akan ditutup pada suatu hari. Namun, seorang pemain bernama Momonga memutuskan untuk tidak keluar. Momonga kemudian berubah menjadi gambar kerangka sebagai “penyihir yang paling kuat.” Dunia terus berubah, dengan karakter non-pemain (NPC) yang mulai merasakan emosi. Tidak memiliki orang tua, teman, atau tempat di masyarakat, pemuda biasa bernama Momonga ini kemudian berusaha untuk mengambil alih dunia baru yang telah diciptakan oleh game ini.
