Tujuh tahun setelah manusia dihancurkan oleh bencana besar, sebuah mercusuar ilmu pengetahuan dan kemakmuran muncul di Kota Kamitsubaki. Namun, di balik bayang-bayangnya, ada monster Tesseractor yang lahir dari kegelapan manusia. Hanya Witchling, lima gadis dengan Song of Purification, yang mampu melawan mereka. Dengan setiap nada, mereka bertarung, tidak hanya untuk melindungi kedamaian kota, tetapi juga untuk menyembuhkan dunia yang hancur.
