Sindrom Pubertas—sindrom misterius yang dikabarkan hanya menyerang mereka yang sedang dalam masa pubertas. Misalnya, seorang gadis kelinci tiba-tiba muncul di hadapan Sakuta Azusagawa. Identitas asli gadis kelinci itu adalah Mai Sakurajima, seorang selebriti remaja yang saat ini menjadi siswa SMA yang tidak aktif. Entah mengapa, sosoknya yang menawan tidak terpancar di mata orang lain. Dalam upaya mengungkap misteri di balik fenomena ini, Sakuta mulai mengeksplorasi perasaannya terhadap Mai. Berlatar di kota tempat langit dan laut bersinar, Sakuta mengungkap makna di balik pertemuan anehnya dengan wanita yang mengidap sindrom tersebut.
